El complejo de Titicaca es, según información del Instituto Nacional de Recursos Naturales (INRENA), el lugar elegido para las especies en peligro de extinción tanto en la fauna como en la flora. Entre las plantas que se encuentran ubicadas en parque bajo esas condiciones se encuentran 12 variedades de plantas acuáticas, entre ellas la totora, una de las más importantes fuentes de sustento de la población lacustre, y entre mamíferos y otros animales, se encuentran en zorro andino, las vizcachas, el cuy silvestre, el flamenco andino, el flamenco de james y la parihuana flamenco. Dentro del Lago Sagrado también se encuentran otros tipos de aves fuera de peligro como por ejemplo el cormorán, el yanavico y el zambullidos del Titicaca

El lago Titicaca comunica el Perú con Bolivia, y dentro de su flora se destaca especialmente la totora, que sirve de alimento no solo para los hombres sino también para el ganado, además de otras utilidades como la construcción de viviendas y embarcaciones. El recorrido permite también acceder a las Chullpas de Sillustani, un increíble y desértico paisaje que se encuentra a más de 4000 mts. de altitud y donde pueden observarse varias torres circulares preíncas que que eran utilizadas como tumbas para importantes personalidades de la nobleza aymará.

Las islas que emergen de las aguas del lago son habitadas casi totalmente por aymarás y los últimos descendientes de los uros, practicando la pesca y viviendo en rudimentarias chozas al igual que sus antepasados. Los habitantes de cada una de estas islas no superan los 50.

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